在我国，外商直接投资的办理涉及多个部门。目前，申请 FDI 投资备案和 FDI 外汇登记主要由外资委、商务部、发改委和外管局审核。

对于外商投资项目核准和备案，不同情况有不同的核准或备案权限。《外商投资产业指导目录》中有中方控股（含相对控股）要求的总投资（含增资）3 亿美元及以上鼓励类项目，总投资（含增资）5000 万美元及以上限制类（不含房地产）项目，由国家发展和改革委员会核准。《外商投资产业指导目录》限制类中的房地产项目和总投资（含增资）5000 万美元以下的其他限制类项目，由省级政府核准。《外商投资产业指导目录》中有中方控股（含相对控股）要求的总投资（含增资）3 亿美元以下鼓励类项目，由地方政府核准。前两项规定之外的属于《政府核准的投资项目目录》至十一项所列的外商投资项目，按照《政府核准的投资项目目录》至十一项的规定核准。由地方政府核准的项目，省级政府可以根据本地实际情况具体划分地方各级政府的核准权限。由省级政府核准的项目，核准权限不得下放。前四条范围以外的外商投资项目由地方政府投资主管部门备案。

对于外商投资企业备案，如宾川县实施机关为宾川发展和改革局。在广州市，对全市现有的 46 个外商投资审批部门进行重新确认，保留为 27 个，撤销 19 个。保留的审批部门必须同时具备三个条件：必须是政府行政部门或由市政府赋予行政管理职能的部门；必须有健全的审批处室，并配备熟悉国家有关利用外资政策、法规的人员；有经市培训并考核合格，持《外商直接投资审批工作人员资格证书》的审批人员。无审批权的部门所属企业设立外商投资企业，由所属委、办转送广州市外商投资管理服务中心、广州外商投资企业协会、广州市私营企业协会申请并转报广州市相关部门受理，也可向设立外商投资企业所属行政区域的外经贸审批部门申请，由其在审批权限内审批或转报受理。

对于外商投资企业办理外汇登记时，企业应向银行提供市场监督管理部门颁发的《营业执照》、核准通知书（按规定无需提交的除外），以及《境内直接投资基本信息登记业务申请表》等材料；除另有规定外，无需提供商务部门出具的外商直接投资审批或备案文件。市场监督管理部门相关信息未能满足外汇登记所需信息的，银行可通过查询企业信用信息公示系统”、企业提交的公司章程 / 合伙协议等，核对企业本次申请外汇登记的信息。